Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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