Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms