Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Klhdc9Q3USL1 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms