Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp25P57080 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp25P57080 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp25P57080 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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