Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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