Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PdgfaP20033 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PdgfaP20033 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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