Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Ccl20O89093 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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Ccl20O89093 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Ccl20O89093 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Ccl20O89093 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Ccl20O89093 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Ccl20O89093 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Ccl20O89093 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccl20O89093 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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