Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Opn1mwO35599 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Opn1mwO35599 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Opn1mwO35599 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Opn1mwO35599 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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