Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp9yF8VPU6 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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