Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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