Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms