Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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