Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms