Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria4Q9Z2W8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria4Q9Z2W8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms