Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms