Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms