Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms