Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Cldn6Q9Z262 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Cldn6Q9Z262 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cldn6Q9Z262 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Cldn6Q9Z262 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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