Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms