Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms