Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D17h6s53eQ9Z1R4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms