Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms