Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nek4Q9Z1J2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms