Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms