Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setbp1Q9Z180 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms