Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ror1Q9Z139 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ror1Q9Z139 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms