Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5Q9Z131 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms