Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema4fQ9Z123 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms