Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NgfrQ9Z0W1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NgfrQ9Z0W1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NgfrQ9Z0W1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NgfrQ9Z0W1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NgfrQ9Z0W1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms