Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip1Q9WUU8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms