Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtrnQ9WU60 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtrnQ9WU60 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AtrnQ9WU60 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AtrnQ9WU60 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AtrnQ9WU60 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms