Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfrQ9WU20 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms