Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms