Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec4eQ9R0Q8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms