Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms