Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nek3Q9R0A5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms