Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms