Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms