Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms