Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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