Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms