Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan3Q9QY33 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan3Q9QY33 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms