Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms