Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nufip1Q9QXX8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms