Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnpy2Q9QXT0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnpy2Q9QXT0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms