Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptf1aQ9QX98 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptf1aQ9QX98 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms