Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms