Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PolkQ9QUG2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.7 ms