Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd1Q9JMH6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Txnrd1Q9JMH6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms