Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gkap1Q9JMB0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gkap1Q9JMB0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gkap1Q9JMB0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gkap1Q9JMB0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gkap1Q9JMB0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gkap1Q9JMB0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gkap1Q9JMB0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gkap1Q9JMB0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gkap1Q9JMB0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gkap1Q9JMB0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms